DNA 凝胶电泳概述
DNA 凝胶电泳是分子生物学中最常用的实验技术之一,用于分离、鉴定和纯化 DNA 片段。本指南详细介绍标准操作流程和关键技巧。
实验原理
在电场作用下,带负电的 DNA 分子通过琼脂糖凝胶网状结构:
- 大片段:迁移速度慢,停留在凝胶上部
- 小片段:迁移速度快,迁移到凝胶下部
- 分离距离:与 DNA 片段大小的对数成正比
凝胶浓度选择
根据 DNA 片段大小选择合适的凝胶浓度:
| DNA 片段大小 | 凝胶浓度 | 说明 |
|---|---|---|
| 100 bp - 500 bp | 2.0% | 高分辨率分离小片段 |
| 500 bp - 1 kb | 1.5% | 标准 PCR 产物 |
| 1 kb - 5 kb | 1.0% | 常规片段 |
| 5 kb - 10 kb | 0.7% | 大片段分离 |
| > 10 kb | 0.5% | 超大片段 |
标准操作流程
1. 凝胶制备
材料准备:
- 琼脂糖粉末
- 1× TAE 或 1× TBE Buffer
- DNA 荧光染料(GelRed、GelGreen 或 EB)
- 制胶模具和梳子
配制步骤:
# 以 1% 凝胶为例
1. 称取 1g 琼脂糖加入 100mL 1× Buffer
2. 微波炉加热至完全溶解(每 30 秒检查一次)
3. 溶液澄清透明表示完全溶解
4. 冷却至 50-60°C(手感温热)
5. 加入荧光染料(10000× 稀释)
6. 轻轻混匀,避免气泡
7. 倒入模具,插入梳子
8. 室温凝固 20-30 分钟
2. 样品制备
| 组分 | 体积 | 终浓度 |
|---|---|---|
| DNA 样品 | X μL | - |
| 6× Loading Buffer | X/5 μL | 1× |
| 总体积 | 通常 10-30 μL | - |
PCR 产物直接上样:
- PCR 反应结束后可直接加入 loading buffer
- 如果产物量少,可不必纯化直接电泳
3. 加样
加样技巧:
- 使用细枪头(10 μL 或 200 μL)
- 枪头垂直对准加样孔中心
- 缓慢推出样品,避免产生气泡
- 每加一个样品后更换枪头或冲洗
- 记录加样顺序和样品信息
4. 电泳条件
| 参数 | 建议值 |
|---|---|
| 电压 | 100-150V |
| 时间 | 20-40 分钟(根据片段大小) |
| Buffer | 1× TAE 或 1× TBE |
| 指示剂 | 溴酚蓝(500bp)或二甲苯青(4kb) |
判断终止时机:
- 溴酚蓝条带迁移至凝胶 2/3 处
- 或目标条带已充分分离
5. 凝胶成像
| 染料 | 激发波长 | 发射波长 |
|---|---|---|
| EB | 302 nm | 590 nm |
| GelRed | 302 nm | 560 nm |
| GelGreen | 254 nm | 520 nm |
| SYBR Green | 254 nm | 520 nm |
成像设置:
- 选择与染料匹配的滤光片
- 调整曝光时间避免过曝或欠曝
- 保存为高分辨率格式(TIF 或 JPEG)
安全注意事项
- EB(溴化乙锭):已知致突变物,操作时戴手套
- GelRed/GelGreen:相对安全,但仍建议戴手套操作
- 所有含有染料的废液需单独收集处理
- 紫外灯下操作需佩戴防护眼镜
常见问题
| 问题 | 可能原因 | 解决建议 |
|---|---|---|
| 无条带 | DNA 量太少 | 增加上样量或浓缩样品 |
| 凝胶浓度过高 | 降低凝胶浓度 | |
| 电泳方向错误 | 确认 DNA 向正极迁移 | |
| 条带模糊 | DNA 降解 | 使用新鲜样品 |
| 电压过高 | 降低电压 | |
| 凝胶过薄 | 增加凝胶厚度 |
本文用于科研实验排查与条件优化,不替代实验室 SOP、试剂说明书或医学判断。