先看阳性对照和内参
如果目标蛋白无信号,但内参清晰,优先怀疑抗体识别、样品表达量或抗原暴露问题。
如果连内参都没有,则更应回到样品制备、转膜和显色体系本身。
无信号快速分流表:
| 观察到的情况 | 指向问题 | 优先排查 |
|---|---|---|
| 整张膜全黑 / 全是背景,没有特异性条带 | 一抗/二抗浓度过高、封闭不好 | 抗体稀释 2-5 倍、换封闭液、缩短曝光时间 |
| 整张膜一片空白,Marker 预染也没有荧光信号 | 显色底物失效、曝光方式错、二抗 HRP 失活 | 换新底物 + 新二抗;Marker 上样量加倍 |
| 预染 Marker 条带清晰可见,但内参/目标都没有 | 转膜正常 → 样品或抗体体系问题 | 检查蛋白提取;加阳性对照;验证抗体 |
| 内参条带清晰,目标蛋白完全没带 | 目标不表达 / 表达极低 / 抗体特异性问题 | 过表达阳性对照 + 提高上样量 + 查表达谱 |
| 内参也弱/没带,Marker 也弱 | 样品 + 转膜 + 显色都有问题,体系整体失效 | 重做整个流程,每一步加对照验证 |
| 胶片上完全没有任何东西,白光下膜上有预染 Marker | 曝光系统 / 化学发光体系失效 | 用新拆封 ECL;用已知有效的阳性样品做对照 |
四个最常见原因
- 上样量不足或蛋白提取失败
- 转膜效率低,蛋白没有真正转到膜上
- 一抗或二抗失活、稀释倍数不合适
- ECL 显色或曝光流程本身存在问题
1. 蛋白提取失败(30% 原因)
蛋白根本没提出来的典型信号:
- BCA/Bradford 定量测出来浓度 < 0.5 μg/μL(上清稀释后)
- 煮样后 Loading Buffer 颜色变透明(没染上蛋白),不是正常的深蓝
- SDS-PAGE 考马斯染色后胶上看不到带 / 非常浅
- 内参也完全没信号(Actin 60 μg 上样量都看不到)
提取失败的常见原因:
| 原因 | 具体情况 | 修复 |
|---|---|---|
| 裂解液加太少 | 6 孔板长满的细胞只加了 50 μL RIPA | 每 10⁶ 细胞加 100-200 μL RIPA;按细胞数来不是按面积 |
| 裂解不充分 | 加了 RIPA 就直接刮下来,4°C 孵育 <10 min | 加 RIPA 后用枪吹打 10 次,4°C 孵育 30 min,期间颠倒 3 次 |
| 蛋白酶失效 | PMSF 加了 1 h 后才裂解(PMSF 水溶液 30 min 失活) | PMSF 临用前现加(1 mM 终浓度),或用 Roche Complete cocktail(稳定) |
| 样本是核蛋白/膜蛋白,用了普通 RIPA | 核蛋白(Histone、转录因子)、膜蛋白(GPCR、通道蛋白)普通 RIPA 抽不出来 | 核蛋白用 RIPA + 超声 5 s × 3 次,或用专门核提取试剂盒(Pierce NE-PER);膜蛋白加 1% NP-40 或 Digitonin |
| 蛋白收集阶段丢失 | 离心 12,000 g 只离心 5 min,碎片还在上清里 | 4°C 12,000 g × 15 min,取上清中间层(不要吸到沉淀,也不要吸最上面的脂层) |
最佳蛋白提取 SOP:
- 6 孔板/细胞瓶:用 PBS 洗 2 次,吸干最后一滴 PBS → 加 RIPA → 刮 → 移至 EP 管 → 4°C 孵育 30 min → 离心取上清 → 定量 → 加 loading buffer → 煮样 5 min
- 组织样本:液氮研磨成粉末 → 按 100 mg : 500 μL 加 RIPA → 冰浴超声 20 s × 3 次(间隔 30 s)→ 离心取上清
2. 转膜问题(25% 原因)
验证转膜是否成功(每次都要做的质控!): 转膜完成后,立刻用丽春红 S(Ponceau S)染膜 5 min:
- 如果丽春红看到清晰的条带梯度(Marker 处也有)→ 转膜 OK
- 如果丽春红一条带都没有 → 转膜完全失败,后面不用孵抗体了
转膜失败的常见错误:
| 错误 | 发生原因 | 修复 |
|---|---|---|
| 三明治夹反了(胶在正极侧,膜在负极侧) | 装膜时记反了正负方向 | 胶在负极(黑边),膜在正极(红边)→ 蛋白从 - 往 + 跑,从胶跑到膜上 |
| 电流/电压/时间不够 | 200 mA × 30 min 做 200 kDa 大蛋白 | 半干:300 mA × 1-3 min/kDa(按目标分子量);湿转:100 V × 60 min 常规,>100 kDa 90 min |
| 转膜时滤纸/胶/膜有气泡 | 做三明治时没赶气泡 → 蛋白无法接触膜 → 形成”斑点空白” | 用玻璃棒/50 mL 离心管滚压排气,每一层都要排 |
| 转膜缓冲液用旧了 / 没加甲醇 | 甲醇不足 → 蛋白结合 NC/PVDF 膜效率低 | 新鲜配制 1× Transfer Buffer:1× Towbin + 20% 甲醇;PVDF 膜必须先用 100% 甲醇活化 15 s |
| 转移时温度过高 | 湿转没放冰盒 → 缓冲液 >40°C → 蛋白降解条带弥散 | 冰袋包着转 + 提前把缓冲液 4°C 预冷 |
3. 抗体体系问题(25% 原因)
一抗问题分类:
- 失活的一抗:反复冻融 >3 次、4°C 放了 >6 个月、-20°C 放了 >2 年
- 稀释倍数不对:按说明书 1:1000 做实际要 1:200 才出带(说明书是”通用条件”不是”你这个样本的最优条件”)
- 孵育时间短:4°C <8 h 孵育对于低丰度蛋白通常不够(建议 4°C 过夜,12-16 h 是最优区间)
- 抗原决定簇被掩盖(最容易忽略):某些抗体只能识别天然蛋白,WB 是变性条件,识别不了 → 要看说明书上有没有 “Applications: WB” 这一栏!
二抗问题:
- 种属错了:一抗是 Rabbit IgG,二抗用了 anti-Mouse → 完全不结合
- HRP 失活:二抗反复冻融 / 4°C 放了 >3 个月 / 叠氮钠污染会完全抑制 HRP
- 浓度不对:稀释 1:10000 太稀 → 信号弱;但稀释过浓又会有背景
抗体孵育的最优条件(新手照着调):
- 一抗:推荐稀释比做预实验 3 个梯度(1:200、1:1000、1:5000),4°C 摇床缓慢摇动过夜
- 封闭:5% 脱脂奶粉/TBST,室温 1 h(或 4°C 过夜)
- 洗膜:TBST 每次 5 min × 3 次,一抗后二抗后都要洗
- 二抗:1:5000 ~ 1:10000(HRP 结合的),室温 1 h
4. ECL 显色 / 曝光问题(20% 原因)
ECL 底物失效判断:
- 拿一点 A 液 + B 液混合 → 加一点已知有 HRP 的废弃二抗 → 如果不发光 = 底物 100% 失效
- 新拆封的 ECL 一般 4°C 有效期 3-6 个月(看说明书),SuperSignal Femto 这种灵敏度高的只有 1-3 个月
- 不要和别人共用 ECL,滴加在膜上的 A/B 液不要回吸到瓶子里(交叉污染会整瓶坏掉)
曝光参数问题:
- 用普通 ECL(灵敏度 ng 级)时,曝光 30 s ~ 5 min 合适
- 用超敏 ECL(pg 级)时,曝光 5 s ~ 30 s,太长会过曝成一片黑
- 如果用凝胶成像仪的化学发光档,需要选对拍摄模式(不要选 UV 模式!不要选 EB 模式!)
- 如果用暗室胶片:
- 显影液/定影液配置对不对?放久了会失效
- 压片时间从 10 s、1 min、5 min、30 min 梯度试
- 胶片完全变黑 = 显影液过热/时间太长
- 胶片完全没东西 = 没压好/曝光时间太短/没信号
建议排查顺序
先确认样品总蛋白和上样量,再看转膜后是否做过 Ponceau 或其它快速染色。
如果转膜正常,再回头检查抗体保存、稀释液和孵育时间。
最后再检查显色底物是否失效以及曝光窗口是否合适。
推荐系统性排查顺序(一步一对照,6 步必出原因):
- 阳性对照 + 内参泳道:每块胶必须有 1 个孔是已知阳性样本(过表达细胞裂解液或该抗体的推荐阳性对照)+ 只加 Loading Buffer 的空白孔
- 转膜丽春红验证:丽春红没看到带 → 直接停,转膜/样品有问题
- 考马斯亮蓝染跑过蛋白后的胶:如果胶上还留着大量蛋白 → 转膜不充分;如果胶也没蛋白 → 提取失败
- 抗体互换验证:用一支你 100% 确定有效的旧抗体 + 同一张膜孵育;如果出带 → 原抗体坏了;如果还是没带 → 样品/转膜问题
- 棋盘滴定:一抗 × 二抗做 3×3 浓度矩阵(1:200/1:1000/1:5000 × 1:2000/1:10000/1:50000),找最优组合
- 换新 ECL 底物 + 新二抗 + 新曝光方法(不要用之前的任何试剂,从拆封开始)
常见修正动作
- 适当提高上样量,但避免一口气加太多。
- 缩短封闭时间或更换更适合的封闭体系。
- 用已知有效样品验证一抗。
- 重新配置新鲜显色底物并缩短操作间隔。
优化上样量的经验:
- 管家基因(Actin、GAPDH、Tubulin):10-30 μg 总蛋白足够
- 高丰度表达的胞质蛋白:20-40 μg
- 中等丰度膜蛋白/核蛋白:50-80 μg
- 低丰度蛋白(磷酸化蛋白、细胞因子、转录因子):80-120 μg + 用超敏 ECL 底物(Femto 级)
- 上样 >80 μg 时必须小心:内参会过曝,背景会高,建议同时做 3 个上样梯度(20/50/100 μg)
封闭体系选择:
| 封闭剂 | 适用场景 | 不适用场景 |
|---|---|---|
| 5% 脱脂奶粉/TBST | 大多数蛋白,便宜好用 | 磷酸化蛋白(奶粉里有大量磷酸化蛋白会竞争!)、生物素标记系统(奶粉里有生物素) |
| 1-5% BSA/TBST | 磷酸化蛋白(特异性好)、生物素系统 | 某些抗体可能背景高;BSA 要选无蛋白酶/无 IgG 的组分 V |
| 商用封闭液(Odyssey、Millipore) | 荧光 WB、超敏 WB、背景难消的情况 | 贵,没必要每次都用 |
延伸阅读:WB 条带弱怎么办、WB 无信号无内参的极端排查、WB 样品制备标准化流程、化学发光信号弱的全面修复。
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