先判断问题发生在样品端还是检测端
同一抗体下某些样品没有条带,先检查目标是否表达、裂解是否合适及实际上样量;若阳性样本也检不出,再检查电泳、转膜和检测。样品准备不能只记录“用了多少微升”,还要记录总蛋白量和处理条件。
本文用于建立可比较的样品制备链路。裂解液、还原和加热方式应按目标与抗体验证,通用流程不能覆盖所有膜蛋白、多聚体或修饰位点。CST 的 Western blot 协议是一个特定体系示例,不能把其中参数当作所有目标的唯一条件。
按节点检查
| 节点 | 记录什么 | 出现异常时先做什么 |
|---|---|---|
| 收样与保存 | 处理组、时间、样本量、冻融次数 | 确认样本可比,避免把处理差异误认成制备误差 |
| 裂解与澄清 | 裂解液、抑制剂、温度、时间及离心条件 | 核对目标定位;必要时保留少量总裂解液和不溶性组分比较 |
| 定量 | 方法、标准品、样本稀释及空白 | 确认缓冲液兼容性,复测曲线与重复孔 |
| 配制上样样品 | 浓度、总蛋白量、最终体积、缓冲液终浓度 | 先算体积是否能装入孔,再统一各泳道条件 |
| 加热与还原 | 温度、时间、还原剂及抗体要求 | 对照已验证条件,避免加热越久越好的假设 |
裂解和定量:留下能定位问题的对照
新目标不应只依据“裂解液很强”选条件。若目标主要在不溶性组分,单看澄清上清可能误判为不表达;但保留组分不等于可以未经处理直接上样。需要时参考裂解液选择指南。
定量标准曲线和样品稀释液要尽量匹配。去污剂、还原剂或其他组分的兼容性应查定量试剂说明;若出现明显干扰,先调整检测方法或样品处理,不靠重复读数取平均来掩盖问题。
上样算例:蛋白量和最终体积一起算
以下是配液演示,不是推荐所有样本都上样 10 µg。假设每孔最终体积 20 µL,使用 4× 样品缓冲液,目标上样 10 µg:
| 样品 | 蛋白浓度 | 样品体积 | 4× 缓冲液 | 兼容稀释液 | 最终体积 |
|---|---|---|---|---|---|
| A | 2 µg/µL | 5 µL | 5 µL | 10 µL | 20 µL |
| B | 1 µg/µL | 10 µL | 5 µL | 5 µL | 20 µL |
计算式为 样品体积 = 目标蛋白量 ÷ 样品浓度。还原剂若单独添加,也要计入最终体积,并扣减稀释液。可用上样量计算器复核。
若样品 B 要上 20 µg,仅样品就需 20 µL,已没有空间加入缓冲液。应重新选择目标上样量、孔容量或经验证的浓缩方法;不能省掉样品缓冲液,也不能只给某一泳道随意改变比例。最终裂解液组分也应尽量保持可比。
如何确认上样和转膜可比
保留已知表达目标的阳性样本。用总蛋白染色或已验证稳定的内参辅助检查上样与转膜,再比较目标条带;单一内参正常不能证明每种分子量的目标都转膜良好。
样品粘稠、泳道拖尾或出现多条带时,先对照处理与上样记录。不要同时增加上样量、改变加热条件和提高抗体浓度,否则难以知道哪一步有效。转膜检查见转膜与封闭。
暂缓比较的情况
若样品标签不清、定量受干扰、实际输入无法核对,或阳性样本也失效,应先修复链路,再解释组间差异。保留原始图像、未裁剪膜图和操作记录,说明重做或排除的理由。
参考资料
- CST Western Blotting Protocol:样品、转膜与检测的厂家流程。
- Bio-Rad Western blot 排错指南:从信号问题追溯制备与检测环节。
留言与回复
写留言 ↓不便公开的内容,可使用私密反馈 ↗