反转录是什么
反转录(Reverse Transcription, RT)是以 RNA 为模板、在反转录酶(Reverse Transcriptase, RTase)催化下合成互补 DNA(complementary DNA, cDNA)的过程。反应依赖引物(Oligo(dT)、随机六聚体或基因特异性引物)提供 3’-OH 起始合成。常用酶包括 M-MLV、SuperScript 系列、Maxima 等。产物 cDNA 可长期保存,并作为 PCR / qPCR 的模板。
为什么反转录重要
RNA 易降解且不能直接作为 Taq 酶的模板,必须先反转录为稳定的 cDNA 才能进入 PCR 流程。反转录效率直接决定下游定量的准确度:相同 RNA 起始量,反转录效率差 2 倍,下游 qPCR Ct 值会整体偏移约 1 个循环。它是 RT-PCR、RT-qPCR、RNA-seq 建库的共同前置步骤,是 RNA 研究的”瓶颈环节”。
常见误区
- Oligo(dT) 与随机引物混用而不验证:随机六聚体可提高低丰度转录本检出率,但容易高估 18S/28S rRNA,需要根据目标选择。
- RNA 起始量超载:>1 µg 总 RNA 反应体系易饱和,cDNA 产率不线性,建议做梯度摸索。
- 省略 -RT 对照:不做无酶对照时,基因组 DNA 残留会被当成阳性信号,导致结果虚高。
- 反复冻存 cDNA:cDNA 不耐反复冻融,建议分装保存于 −20 ℃,3 个月内用完。
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