排查向导

核酸提取得率低 / 纯度低排查向导

从样本输入、裂解、结合洗涤、洗脱和定量方式排查 DNA/RNA 提取得率低或纯度低问题。

DNA/RNA 浓度低A260/280 或 A260/230 异常下游 PCR/qPCR 被抑制

适用场景

遇到以下现象时,建议按下面的排查顺序逐步缩小范围,而不是一次性同时调整多个变量。

  • DNA/RNA 浓度低
  • A260/280 或 A260/230 异常
  • 下游 PCR/qPCR 被抑制
01

先确认样本输入是否足够且一致

样本量、细胞数、组织质量或起始体积是否低于试剂盒建议范围?

如果正常

输入量合理时,继续排查裂解和纯化步骤。

如果异常

输入量过低或样本保存差会直接导致得率低。

可能原因

  • 起始样本不足
  • 样本降解
  • 冻融次数多

推荐处理方式

  • 标准化输入量
  • 减少冻融
  • 记录样本保存时间和条件
02

检查裂解是否充分

组织是否完全破碎?细胞团块是否残留?裂解时间和温度是否符合说明书?

如果正常

裂解充分时,再看结合和洗涤环节。

如果异常

裂解不足会让核酸留在样本残渣中。

可能原因

  • 匀浆不足
  • 裂解液比例不够
  • 蛋白/多糖干扰

推荐处理方式

  • 延长裂解
  • 增强匀浆
  • 按样本类型调整裂解液比例
03

复核结合、洗涤和离心条件

乙醇比例、柱结合时间、洗涤次数和离心速度是否正确?

如果正常

纯化条件正确时,继续看洗脱和定量。

如果异常

乙醇比例或洗涤残留错误会同时影响得率和纯度。

可能原因

  • 乙醇漏加
  • 盐残留
  • 柱膜过载

推荐处理方式

  • 核对乙醇添加记录
  • 增加干柱离心
  • 避免超过柱容量
04

优化洗脱体积和洗脱方式

洗脱体积是否太大?洗脱液是否充分覆盖柱膜?

如果正常

洗脱合理时,浓度低可能来自样本或测量方式。

如果异常

洗脱体积过大导致浓度低,覆盖不足会降低总回收量。

可能原因

  • 洗脱体积过大
  • 洗脱液未覆盖膜
  • 未预热洗脱液

推荐处理方式

  • 减少洗脱体积
  • 室温静置后离心
  • 必要时二次洗脱
05

区分真实低纯度和测量误差

Nanodrop、Qubit 和电泳结果是否一致?A260/230 是否偏低?

如果正常

多种方法一致时,结果可信,可以继续优化提取。

如果异常

光度法受污染物影响大,可能高估或低估核酸质量。

可能原因

  • 盐/酚/胍盐残留
  • 蛋白污染
  • 光度法干扰

推荐处理方式

  • 用荧光法复核
  • 跑胶看完整性
  • 必要时做二次纯化

复制排查清单

勾选已经完成的步骤后,可以复制一份文字版排查记录,用于实验记录或发给同事复核。

排查清单预览