先缩小范围
DNA 胶上 Marker 清楚、位置正常,但样品泳道没有条带,通常说明胶、缓冲液、电压和成像流程大概率可用。
这时不要先重配整套电泳系统,而应回到样品本身和上样步骤。
重点判断三件事:
- 样品中是否真的有足够 DNA。
- DNA 是否已经降解、丢失或被抑制染色。
- 上样时样品是否进入孔内并留在泳道中。
常见原因
样品量太低
如果 DNA 浓度低、体积少,条带可能低于成像检测下限。
这类情况常见于 PCR 产物很少、胶回收前样品很稀、提取产物本身浓度偏低。
上样失败
样品没有进孔、孔破损、枪头戳穿胶孔、loading buffer 比例不合适,都会造成样品扩散或跑出孔外。
如果泳道口附近有模糊阴影但没有清晰条带,尤其要检查上样动作。
样品降解或片段过小
DNA 已经降解时,可能看不到预期条带,只剩很弱的弥散背景。
片段很小时,如果胶浓度不合适或跑得过久,也可能跑出可观察区域。
染料或成像条件不匹配
Marker 自带染料或浓度较高,能显示清楚;样品如果未充分染色、染料浓度不足或成像设置不合适,也可能看不到。
PCR 本身没有产物
如果样品是 PCR 产物,Marker 正常只说明电泳正常,不代表 PCR 成功。
这时应同步回看模板、引物、反应体系和程序。
排查顺序
- 确认样品浓度和预计上样量。
- 看上样记录,确认样品、loading buffer 和水的比例。
- 观察孔附近是否有残留、扩散或漏孔痕迹。
- 调整曝光或成像参数,确认不是信号太弱。
- 对 PCR 产物,加入阳性对照或历史成功样品。
- 必要时提高上样量、缩短跑胶时间或调整胶浓度。
怎么快速验证
可以把同一样品分成两种上样条件:
- 原始上样量
- 增加 2-3 倍上样量
如果增加上样量后出现弱条带,说明主要是样品量不足。
如果仍完全没有信号,而阳性对照正常,就要回到样品制备或 PCR 反应本身。
工具辅助
- 用 样品上样量计算 估算每孔 DNA 量是否足够。
- 用 Buffer 配制计算 复核 TAE/TBE 或上样相关缓冲液。
- 如果是 PCR 产物,可以结合 PCR 反应体系计算 重新核对体系。
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继续用工具完成条件判断和计算
本文用于科研实验排查与条件优化,不替代实验室 SOP、试剂说明书或医学判断。